腫瘍内科医です。
１．AST/ALTを上昇させた被疑薬としてアブラキサン（nab-PTX）、ハーセプチン（Tmab）を疑っているものと思いますが、その他に継続している薬があったらそれらも疑うべきです。もし他に被疑薬がなくても、薬物によって障害された肝臓が1週間で100%改善するわけではありません。目立った悪化がなければ良しとすべきでしょう。
２．術前・術後化学療法はできる限り休みを入れず、スケジュール通りに実施することが重要です。そのため、副作用に対しては薬の減量や延期ではなく、予防で対応することが優先されます。ただ、肝障害は予防が困難で治療もなかなか思うようにいきません。４で述べますが、できる範囲で改善を図っていくしかありません。
根治を目指すときの治療方針は標準治療の中から選択し、一度決めたら原則として変更しないのが原則です。抗HER2薬を含む術前化学療法→手術→術後抗HER2療法は標準治療ですので、できる限り最初に決めたスケジュールで治療を完遂すべきです。
3. 途中で治療を変更することがメリットにつながる保証はありません。化学療法が全く効いていないのであれば早急に手術を行い術後化学療法を開始すべきですが、奏功したのなら予定通りの治療を完遂すべきと思います。
セカンドオピニオンは全く必要ありません。時間と金の無駄です。
4. 劇的に効く薬はありません。おまじない程度です。ウルソデオキシコール酸（商品名ウルソなど）、強力ミノファゲンなどを使うことが多いです。早く治療を再開したいのですからおまじない程度でもこれらを使ったほうがよいでしょう。
手元の教科書で調べてみると、AC療法のドキソルビシン（商品名アドリアシン）は総ビリルビン（T.bil） 1.2 mg/ml 以上で50%、3.1-5.0 mg/dl で25%に減量、5.0mg/dl以上で中止、となっていますが、AST/ALTの値に応じて調節することは推奨されていません。肝代謝型の薬剤なので、肝障害により血中濃度が上昇することが指摘されており、T.bil 正常であっても好中球減少、心毒性などに十分注意が必要でしょう。
シクロフォスファミド（商品名エンドキサン）について、（私の教科書では）肝障害時の減量は不要となっていますが、減量を推奨するガイドラインもあるそうです。ですが、術前化学療法で治療密度（dose-intensity）の維持が求められる状況ですから、副作用への対応を準備しつつ治療を進めることを優先すべきと思います。
治療を再開するAST, ALTの値に正解はないと思いますが、一般常識に照らせばともに100 IU/L未満になれば再開、でよいように思います。おまじない程度でも肝庇護療法を行いながら、という前提です。
参照：ハイリスク患者の化学療法ナビゲーター 高野 利美 編、メジカルビュー社、2013、東京
治療の成功をお祈りしております。
お大事にどうぞ。
